Kvalitetssäkrade flerartsanalyser (Metabarcoding)
Vi har utfört mer än 60 projekt med metabarcoding på eDNA med lyckat resultat. Läs gärna exempelrapporter som finns öppet tillgängliga här. Metoden har verifierats för fisk i intensivt provfiskade områden, där vi trots 50-års intensiva provfisken hittade arter som inte detekterats tidigare. Dessa ytterligare arter kunde verifieras genom kompletterande inventeringar. Metoden är mycket tillförlitlig när det gäller att beskriva artsammansättningen av fisk i vatten, och vi har använt den i hav, sjöar och vattendrag. Även för groddjur har vi jämfört resultaten med konventionell inventeringsmetodik, och utfallet för eDNA blev bättre. Vi har framgångsrikt använt flerartsanalyser även för däggdjur, och såväl marina som landlevande däggdjur har detekterats via vattenprover. Flerartsanalyser är en lämplig metod för att ta reda på vilka arter som förekommer i ett vatten samt vilka arter som är dominerande eller sällsynta. Till exempel kan vi svara på vilka fiskarter som finns i en specifik sjö och hur fisksamhället ser ut.
Våra undersökningar med olika genetiska primers i varierande miljöer sparas även i vår egen databas för eDNA. Detta ger oss information om hur väl primers prestera mot specifika arter under varierande miljöförhållanden, vilket vägleder oss i valet av genetisk primer. Vår breda erfarenhet ger också en god grund för att ge våra kunder den mest kostnadseffektiva kombinationen av labbteknik, leverantör, primers och provtagning design som uppnår det önskade resultatet.
Slutligen har vi en kvalitetssäkrad process från insamling av vatten till färdig rapport. Detta inkluderar bland annat miljö och artspecifik provtagnings design, kontamination och korskontamination säker provtagning, leveranskedja som bibehåller DNA:ts kvalité samt validering av sekvensernas artannotering
Kvalitetssäkrade enartsanalyser
Vi har även väl fungerande processer för att analysera en specifik art. Detta gäller till exempel större vattensalamander, flodkräfta, svartmunnad smörbult, flodpärlmussla och många andra arter. Denna metodik är känsligare än metabarcoding för detektion av specifik art. Metoden lämpar sig väl för screening av regioner för invasiva och sällsynta arter. Nyligen så fann vi att svartmunnad smörbult börjat vandra upp i gotländska vattendrag, vilket kunde påvisa via screening av samtliga betydande vattendrag (33), vilket kunde undersökas inom en arbetsvecka.
Metod är billigare än flerartsanalyser och tillåter därmed inventering av flera lokaler inom en satt budget. En tumregel är att analysen upp till tre enart-analyser tenderar att vara billigare än en metabarcode analys.
Utvecklingsprojekt
Som utvecklingsprojekt erbjuder vi att testa nya undersökningstyper eller helt nya angreppssätt, utifrån kunders behov eller inom forskningsprojekt. Ofta utförs dessa utvecklingsprojekt i samarbete med framstående forskningsinstitutioner inom eDNA, med målsättningen att kunna erbjuda våra kunder det senaste bland kvalitetssäkrade genetiska undersökningar.